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Il s'agit du plus vaste étang lagunaire de Corse et d'un site exceptionnel en Méditerranée, d'intérêt international pour les oiseaux et pour la faune et la flore aquatiques en général.
L'intérêt écologique de Biguglia est lié à la présence d'un herbier dense de phanérogames (à Zostere, Ruppia et Potamots avec une zonation qui est fonction de la salinité), abritant une faune d'invertébrés et de poissons (dont une espèce d'intérêt européen l'Aphanius de Corse : annexe II) riche et diversifiée, qui permet la reproduction et le stationnement de nombreuses espèces d'oiseaux d'eau. les rives de l'étang sont occupées par des roselières abritant une population de Kosteletskia à cinq fruits ( Kosteltzkya pentacarpos ), annexe II, des prés salés, des sansouires, des aulnaies marécageuses et des tamarissaies ; c'est un paysage végétal peu fréquent en Corse, physionomiuement dominé par des espèces eurosibèriennes, avec certains ensembles de végétation assez rares en méditerranée et d'intérêt européen. A cela se rajoute une partie du lido qui comporte un certain nombre d'habitats de plages et dunes ainsi qu'un Limonium endémique très rare (Limonium strictisimum)
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Le site de Biguglia occupe la quasi totalité du rivage de la plaine de la Marana. D'origine lagunaire par remaniement marin des alluvions du Golo, le site de Biguglia a pour pourtour des zones situées sur des alluvions récentes avec qques tâches d'alluvions anciennes (San damiano). Le bassin versant est situé en zone schisteuse (schistes lustrés) et sur des alluvions anciennes. la partie du lido incluse dans le site natura 2000 est constituée de sables |
| Composition du site : |
| Eaux douces intérieures (Eaux stagnantes, Eaux courantes) |
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92 % |
| Dunes, Plages de sables, Machair |
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2 % |
| Forêts sempervirentes non résineuses |
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2 % |
| Marais salants, Prés salés, Steppes salées |
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1 % |
| Prairies semi-naturelles humides, Prairies mésophiles améliorées |
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1 % |
| Forêts caducifoliées |
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1 % |
| Landes, Broussailles, Recrus, Maquis et Garrigues, Phrygana |
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1 % |
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