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Site exceptionnel par la diversité des habitats d'intérêt communautaire présents ainsi que par le caractère original des associations de groupements et de leur agencement spatial. Le haut estran est occupé par des prés-salés atlantiques, des groupements d'annuelles à Salicornes, des prairies à Spartines ainsi que des fourrés halophiles thermo-atlantiques (habitats annexe I). Ces groupements pénètrent localement dans des boisements à sous-bois de Molinie, Callune et Ajonc, dans des landes humides à sphaignes (habitat prioritaire) et des jonchaies dulcicoles, produisant des transitions floristiques remarquables.
L'extension du site de 2008 comprend la partie sud de la ria, entre la partie nord déjà classée Natura 2000 et la barre d'Etel, à l'embouchure. Elle vise à intégrer dans le réseau Natura 2000 l'ensemble fonctionnel de la ria d'Etel dans son entier
Elle peut se diviser en deux :
- une partie sud étroite, de Pont-Lorois jusqu'à l'embouchure. Elle offre dans cette partie une proportion relativement importante de fonds rocheux, grâce aux violents courants de marée qui les dégagent des sédiments. Ce biotope est un milieu naturel particulièrement original. Immédiatement au-dessous de l'estran, des taillis de cystoseires couvrent les roches du rivage, en alternance avec des prairies de zostères. Bien qu'hypertrophique, ce milieu conserve une bonne biodiversité. La vitesse des courants de marée dans ce chenal, le non envasement du lit de la rivière, la proportion importante de fonds rocheux permettent à la faune sous-marine d'y atteindre une biomasse d'une productivité maximale.
- une partie centrale assez semblable à la partie nord, mais avec une occupation ostréicole très développée. Cette zone estuarienne à faible pente est dominée par des formations sédimentaires de faible granulométrie. Cette slikke est très peu colonisée par les herbiers de Zostères).
En superposition avec l'habitat 1110, 1130 et 1140 la superficie de l'habitat 1160 ( grandes criques et baies peu profondes) est estimée à 43% de la surface du site soit environ 1834 ha.
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| Estuaire aux multiples indentations et îlots, découvrant de grandes étendues de vasières à marée basse, constituant une mosaïque de milieux tout à fait originale où s'entremèlent prés-salés, landes, plans d'eau, boisements, slikkes, chenaux. |
| Composition du site : |
| Rivières et Estuaires soumis à la marée, Vasières et bancs de sable, Lagunes (incluant les bassins de production de sel) |
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20 % |
| Autres terres arables |
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16 % |
| Landes, Broussailles, Recrus, Maquis et Garrigues, Phrygana |
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15 % |
| Forêts mixtes |
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10 % |
| Mer, Bras de Mer |
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10 % |
| Marais salants, Prés salés, Steppes salées |
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9 % |
| Prairies semi-naturelles humides, Prairies mésophiles améliorées |
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5 % |
| Galets, Falaises maritimes, Ilots |
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5 % |
| Eaux douces intérieures (Eaux stagnantes, Eaux courantes) |
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3 % |
| Prairies ameliorées |
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3 % |
| Forêts caducifoliées |
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2 % |
| Marais (vegetation de ceinture), Bas-marais, Tourbières, |
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2 % |
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10 km 
Appelation :
Région :
